O Programa de Monitoramento da Qualidade da Água Superficial, Subterrânea e Efluentes Líquido avalia e monitora a qualidade da água em diferentes fontes, tais como rios, lagos, aquíferos subterrâneos, efluentes líquidos, entre outros. O objetivo do programa é garantir a proteção da água e a saúde humana, além de assegurar que a mesma esteja de acordo com padrões de qualidade para o seu uso. O monitoramento pode incluir a avaliação da presença de contaminantes, como produtos químicos, materiais tóxicos, entre outros, e a verificação de que a água esteja de acordo com padrões de qualidade para uso humano, industrial e agrícola.